1.1.如何禁止某程序联网;

1.2.禁止某个文件夹下的程序和文件联网，具体怎么设置？

打开防火墙设置--》添加新应用规则--》规则的名称为你指定的目录（比如C:\迅雷下载\*星号是指所有程序）--》使用的规则为被拦截的应用程序

1.3.限制某个程序的上传或下载速度；

这个真没有

2.禁止某程序运行时自动运行其更新程序（或运行其它无用程序），比如：如何禁止百度输入法自动运行其输入法更新程序？

打开HIPS设置--》添加一条百度输入法的应用规则--》使用的规则为自定义--》运行一个可执行程序这一条排除里

阻止的文件/文件夹里添加输入法的更新程序

3.如何对某个文件夹进行权限保护，如：禁止在该文件夹中创建文件（夹）、禁止读取或写入该文件夹等等。

可以在被保护的对象里受保护的文件里添加你指定的文件夹（用于受信任的文件，受信任的厂商，允许的程序之外的所有程序）

或者在应用程序规则受保护的文件/目录这一条排除里阻止的文件/文件夹里添加你指定的文件夹（用于单个程序）

4.禁止某程序开机启动。

阻止添加开机启动项要看弹窗，开机启动的方法太多了

comodokillswitch里的autorunanalyzer可以管理开机启动项