国家出入境检验检疫局徽章由蛇杖、天平、长城、橄榄叶组成，深蓝底色，除国徽以外，其他部分均为金黄色。整体形状为圆形盾牌，寓意安全与保护。

国徽是国家的象征和标志，表示出入境检验检疫局依照国家的法律、法规行使职权，维护国家利益。

深蓝底色，象征出入境检验检疫局科学的管理与精湛的技术；蛇杖由交缠在橄榄枝上的两蛇和伸展的双翼组成，为国际通用标志，代表国际贸易；天平代表出入境检验检疫局工作的公证性与准确性，圆规与等边三角形表现检验检疫行业特色，即“没有规矩，不成方圆”；长城表示出入境检验检疫局的执法把关职能；环绕的橄榄叶，象征枝繁叶茂，借寓出入境检验检疫事业蓬勃发展。