1.预防为主，加强管理。地下水污染的防治首先应立足于防，这是由地下水污染的特殊性所决定的，地下水污染一般不容易发觉。各级政府的水资源保护管理职能部门要加大监督管理力度，严格执行国家有关法律法规和规定，按地下含水系统地下水盆地、地下水系统评价资源，从水量及水质两方面保护地下水资源；

2.加强供水水源地保护。保护作为供水水源的地下水免受污染，是一项十分重要的工作。进行城市规划时，应将可能形成污染源的居民点、厂矿企业布置在远离含水层补给区的下游方向；

3.综合防治地下水污染。鉴于地下水污染的治理相当困难，防治工作的重点是控制污染源，有效地切断污染物进入地下水的途径。合理适当地施用氮肥，使所施氮肥既能满足作物生长需要又不过量，是减少农耕区地下水硝酸盐污染的重要措施。