南京信息工程大学,具有完整的学士、硕士、博士教育培养体系，为世界气象组织成员，是一所以大气科学为特色，海洋、信息、环境、管理等多学科协调发展的全国重点大学。南京信息工程大学前身南京气象学院始建于1960年，1978年为全国重点大学.

南京工程学院是江苏省属普通本科高校，坐落于历史文化名城南京。学校是全国高等院校应用型本科院校专门委员会主任委员单位，全国服务特需硕士研究生培养单位联盟副理事长单位，新建本科院校教学工作合格评估方案主要起草单位，也是教育部卓越工程师教育培养计划和教育部CDIO工程教育改革首批试点高校。

综上所述，两个各有特色，各有千秋。