1.草业科学：甘肃农业大学堪称”全国草业领域的黄埔军校”，全国草业学科排名第一。同时，它还拥有甘肃省省属院校中唯一的国家重点学科，全国草业领域内的业务骨干百分之70都来自于甘肃农业大学草业学院。

2.动物医学：甘肃农业大学的动物医学专业在全国处于前列。近年来，有百分之30左右的毕业生考取该专业的硕士研究生继续深造。

3.水土保持与荒漠化防治：该专业成立于1986年，是我国目前仅有的三个环境生态类专业之一，主要学习水土保持和荒漠化的相关知识，毕业生可在国土资源、水利、农业、林业、环保等部门从事相关工作。

4.土地资源管理：该专业以土地科学为主体，以土地信息技术、测量与制图技术为两翼，毕业生就业率很高。

5.农业机械化及其自动化：该专业在小麦收获技术与机具、保护性耕作与机具、种子加工技术与机械、牧草收获加工机械、甘肃特色作物生产机械技术等研究方面有一定的优势。