含金量的不同。执业医师资格的含金量明显是要高于执业助理医师的。考取卫生资格中级职称必须要先考执业医师资格。虽然同属初级职称，但执业助理医师的薪资福利待遇以及补贴都要低于执业医师。报考门槛的不同。报考执业医师资格必须具备高等学校医学专业本科及以上学历，且在执业医师指导下，在医疗、预防、保健机构中试用期满一年。如果只有专科学历，则必须先考取执业助理医师资格，获取从业资格之后，还必须要在正规的医疗、预防、保健机构中工作满一定年限才能报考。考试难度的不同。实践技能考试部分差别大，但在医学综合笔试部分，执业助理医师考试的难度要比执业医师低得多。同样的考试时间内，执业助理医师的笔试题总题量只有执业医师的一半。发展前景的不同。在正规医疗、预防、保健机构中，拥有执业医师资格的人可以聘为医师，执业医师拥有申请异地、跨省执业的资格，但是执业助理医师只能在县级行政区域内执业。