港澳通行证团队与个人自由行的区别如下：

办理个人通行签证，只能是已经开通港澳自由行的城市居民方可办理，如果是没有开通自由行的城市的居民只能办理团队通行签证。但是无论个人通行签证还是团队通行签证，都可以到参团旅游或是自由行。过关方式不同：签注为个人通行签证的，可以从自己所在城市直接过关飞往香港；团队通行签证的只能选择在深圳或珠海出关，不可以直飞香港。但都可以从香港直飞回大陆国内城市。在深圳各关口过关去香港时，个人通行签证可自行过关，不会产生任何费用；团队通行签证需要有港澳旅游发团资质的旅行社做团队旅游名单并由导游送过关，会产生送关服务费，送过关之后，方可以自行前往香港。港澳通行证办理流程：1、完整填写贴有本人近期正面免冠半身彩色照片的《中国公民出入境证件申请表》；2、提交《出入境证件数字相片采集回执》。3、交验有效居民身份证或临时身份证原件，并提交复印件。