小智有很多神奇宝贝，主要是：

1.皮卡丘：小智最初的伙伴，具有顽强的性格，不愿意进入神奇宝贝球也不愿进化，起初与小智并不友好，在与烈雀的战斗中和小智建立了坚不可摧的友情。绝招是电击、十万伏特、打雷、电光一闪、铁尾、高速移动、高压电击。

2.比比鸟：小智收服的第二只神奇宝贝，在关东地区的旅行中，比比鸟参加了一系列的道馆和联盟的比赛。绝招是烈暴风、飞沙脚、啄、翅膀攻击、旋风、电光一闪、旋转。

3.绿毛虫：在阻止火箭队的袭击中，它进化成了铁甲蛹。绝招是冲击、吐丝、硬梆梆、睡眠粉、麻痹粉、旋风。

4.妙蛙种子：在不思议花园中，妙蛙种子拒绝了进化。获得过草系神奇宝贝锦标大会亚军。绝招是冲击、寄生种子、藤鞭、飞叶快刀、睡眠粉、阳光烈焰，挖地洞。

5.小火龙：打败椰蛋树军团后进化为火恐龙。绝招是喷射火焰、地球上投、龙之怒、旋风、愤怒、龙吸、火箭头槌、火焰漩涡、重击、瞪眼、燃烧殆尽、钢之翼。