物流企业主要从事代理服务和运输、仓储等业务，因为同时涉及交通运输业和服务业，且两种行业的税率又有所不同，这就为其进行纳税筹划提供了空间。在原来的营业税政策下，物流企业承担的税负主要是交通运输业收入的3%和服务业收入的5%。而营改增之后，物流企业则面临有形动产租赁收入的17%、交通运输业收入的11%和服务业收入的6%的增值税税率负担。由于两个税种不同的计税方式，所以不能片面地仅从税率高低上来判断税负的大小，如果企业的进项较多，那么增值税负可能较营业税负低，即便进项不多，也还可以选择按照小规模纳税人的征税方式纳税，存在着税务筹划的空间。增值税差额征税是指试点地区提供营业税改征增值税应税服务的纳税人，按照国家有关营业税差额征税的政策规定，以取得的全部价款和价外费用扣除支付给非试点纳税人和特定试点纳税人的规定项目价款后的不含税余额为销售额，作为增值税计税依据。