关于是谁刺杀了宋教仁有多种说法：

1.袁世凯杀宋说：据说袁害怕宋教仁以合法手段取得权利，后见收买不成，便布置歹徒，对宋教仁下了毒手。《宋教仁被刺案内应夔丞家搜获函电文件》中收录了，案发前后，应桂馨和袁世凯，洪述祖来往的电报。电报内容已经赤裸裸说明袁世凯杀宋教仁的意图；

2.赵秉钧杀宋说：根据在场目击证人和其他人士举报，嫌凶很快就锁定在无业流氓武士英头上，随后又有古董商王阿法举报，短短三天，凶手武士英和他背后的应桂馨双双被缉拿归案；

3.陈其美杀宋说：辛亥革命前，同盟会发生过两次倒孙风潮，在这两次倒孙风潮中，宋教仁都没有站在孙中山一方。由此，陈其美等铁杆拥孙派对宋颇为怀恨。

因为宋案当年没有真正经过司法程序开庭审理，二次革命就爆发了，所以从法律的角度讲，没有直接证据能够证明谁是真正刺杀宋教仁的幕后黑手，它至今是个谜。