百菌清为广谱保护性杀菌剂，化学性质稳定，无腐蚀作用，对人畜低毒，对鱼类毒性大，主要防治多种真菌性病害，但对土传腐霉属菌所引起的病害效果不好，对多菌灵产生抗药性的病害，改用百菌清防治能收到良好的效果。

多菌灵为内吸性杀菌剂，对热稳定，对酸、碱不稳定，兼有保护和治疗作用，内吸传导主要是向顶型，对人、畜、鱼、蜜蜂低毒，在土壤中易分解失效。

百菌清属于触杀剂，即杀菌剂沉积在植物表面上与病原菌发生接触时杀灭或抑制病菌，这种药剂或者不能被植物吸收或者被植物吸收后立即分解失效，对植物体内的病菌不发生作用。

多菌灵属于内吸剂，即该药剂能被作物吸收到体内而不失效，能对植物体内的病原菌发生作用，这种药剂也称化学治疗剂，一般用于发病的植物，但大多数内吸剂也兼有触杀的作用。