上海中医药大学的中医科排名和实力最强，排名全国第一。

上海中医药大学的前身是上海中医学院，创建于1956年，是新中国诞生后国家首批建立的四所中医药高等院校之一，也是上海市属高校中唯一的一所医科类重点特色院校。截止2013年11月，学校建有国家重点学科4个，国家重点学科2个，国家重点学科数居全国中医院校第二、上海地方高校之首。有中医学、中西医结合医学、中药学3个一级学科博士点，15个二级学科博士点，23个硕士点，3个博士后流动站，博士学位授予专业覆盖全部中医药学科。在2010年的全国博士后流动站评估中，中药学科被评为全国唯一的中药一级学科“优秀”流动站。有38个中管局重点学科，9个上海市重点学科，5个上海市教委重点学科。