太平洋水系：

1.长江水系：金沙江、龙川江、螳螂川（普渡河）、小江、以礼河、牛栏江、横江、程海、泸沽湖、滇池等，注入东海。2.珠江水系：南盘江、曲江、可渡河、黄泥河、驮娘江、抚仙湖、星云湖、杞麓湖、阳宗海、异龙湖等，注入南海。

3.元江（红河）水系：礼社江、绿汁江、把边江、阿墨江、李仙江、南溪河、盘龙江等，注入北部湾。

4.澜沧江（湄公河）水系：漾濞江、威远江、曼老江、南腊河、南览河、流沙河、洱海等，注入南海。

印度洋水系：

1.怒江（萨尔温江）水系：老窝河、枯柯河、南汀河、南滚河、南卡江等，注入安达曼海。

2.伊洛瓦底江水系：独龙江、槟榔江、大盈江、瑞丽江等，注入安达曼海。